
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物学 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研发报告
学习人来探寻跟随保鲜精力延迟牛羊肉的光洁度、持混流式水轮机、色彩、散布铁分子量、ROS、脂质过被非金属氧化物、MDA、GSH和GPX4关卡来评价指标背部肌肉策划 体细胞核的铁窒息死亡的状态。后果出现,保鲜精力延迟后,牛羊肉的光洁度在第3天和第6天有效的下降;持水水平下降;色泽变深,得不到有光泽,鲜颜色转变成暗颜色。不仅如此,散布铁、吸附性氧和MDA的分子量有效提升,体细胞核凋亡率有效提高。 探索的人员添加不一样的冷藏库时的力量图纸的淀粉酶质,后来做SDS-PAGE研究进行分析,淀粉酶质条带在不一样的期间匀称不均且相类似(图1a)。据淀粉酶在不一样的图纸中的把你想表达出来情况报告,研究进行分析发觉同组图纸的中五位数非常接近于同技术水平(图1b),证明力量图纸淀粉酶质有优秀的组内相类似性和组间一定的差异化朋友。 核胆固醇组学共认定出1996种核胆固醇。以B0为对比组,淘汰B1、B2、B4和B6中的核血清实行一定的差异性呈现具体具体分析,共认定到37七个DEPs。将火山图web3d,并跟据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05几个标准规定具体具体分析DEP。结论如下图随时1c-f随时,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别认定出22、33、73和140个DEPs,里面分头别上浮6、11、32和8八个,下跌16、22、41和55个。聚类算法的办法鉴定了有所不同速冻周期胸肌企业中核胆固醇的呈现,结论体现 胸肌核血清呈现一定的差异性现在存放的时间的添加而添加(图1g)。
图1| 不同的要在冷藏室保存时刻的身体肌肉样品英文球蛋白质含量组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各种冷冻箱时光的力量样品英文的差异蛋清讲解(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁致死核蛋白肽的PRM定量分享分享(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 根据KEGG生物富集之间的关系表答蛋白质的铁身亡制度化(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物制品提供了TMT定量分析血清质组学技艺水平安全服务培训,拜谱怪物已科研开发完工并实现了更加完善成长期的转录组学、血清组学、细胞代谢组学或者几组学协力成品技艺水平安全服务培训装修标准,欢迎致电咨询!
符合文献资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.