代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
因素判定：消化吸收组学高能力也行对成药中的化工因素完成局面讲解，判定出名贵中药材材中的几丁质酶酶类因素。举例，凭借系统设计质谱（MS）的消化吸收组学高能力，行判定出冬虫夏草中的冬虫夏草皂苷等几丁质酶酶类因素。这一种高能力还行划分入药和非入药组成部分的化工标记图片物，为成药的效果操纵作为前提。
拜谱生物线质量保持：实现基础消化吸收率组学技艺，也就能够对草药的拜谱生物线质量来进行监测和保持。随后，巧用树种基础消化吸收率组学深入分析，也就能够建设根据类风湿骨痛性髋风湿关节炎的草药的物质的拜谱生物线质量标注的一定量的方式。除外，基础消化吸收率组学还也就能够辨识草药中的致癌性的物质以及致癌性系统，如实现UPLC-Q-TOF-MS设计，辨认其他乌头树种的化学物质的物质，并辨识有镇痛药几丁质酶和慢性致癌性的动物碱。
2. 中药药效机制研究
效果靶点鉴别：分解组学技术性可能幫助鉴别中医活性酶类部分的氧分子靶点。列举，研究分析发现雷公藤红素可采用控制Treg/TH1和Treg/Th17稳定平衡、阻隔NF-κB径路等共识机制激发抗感染效果。
做用原则诠释：细胞新陈分解转化率率组学技艺还应该体现了中西药材调理病毒的做用原则。举例子，钻研挖掘青蒿素耐药性与疟原虫的线粒体细胞新陈分解转化率率影响关于 ，非靶向治疗细胞新陈分解转化率率组学体现了了与该进程关联的细胞新陈分解转化率率物变动。再者，细胞新陈分解转化率率组学还应该借助定量分析细胞新陈分解转化率率物的变动，钻研中西药材复方的做用原则。
3. 中药安全性评价
渗透性措施的研究探讨：基础细胞代谢转化组学方法可以使用的研究探讨药材的渗透性措施。如，采用基础细胞代谢转化组学和16S rDNA测序的转型浅析，证明了清益汤对危重症发生猛然胰腺炎相关的发生猛然肺伤害的防护措施，并确定好了铁镇定自若、距离基础细胞代谢转化物和微海洋生物菌群相互之间的影响。
健康安会可靠性估评：代谢率组学方法还不错应用在成药的健康安会可靠性估评，甄别意向的渗透性组分和渗透性靶点，然而为成药的健康安会可靠运用出具科学性保证。
4. 中医证候研究
证候有关分解物数据分析：分解组学技能能够 代替表现与国医证候有关的内源性分解物转变，帮助国医证候的鉴别诊断和矫治。列举，利用分解组学学习，已在冠相思病病患中判定出与痰瘀证主气阴两虚证有关的菌物因素物。
证候诊治论述：排泄率组学能力还需要中用论述中要对医学证候的诊治体验。如，使用排泄率组学能力及聚类数据分析法数据分析法，遇到“黄芪-茯苓-泽泻”等绑定qq口服口服药选择装配适中用肾病基础性征的新组方口服口服药，也能对四种肾病基础性征涉及到的生物体标志logo物生产作用。
5. 多组学技术整合应用
几组学兼容合并资源：分解组学与其它组学技能（如什么是基因组学、转录组学、蛋白质含量质组学等）的兼容合并资源采用，为药材配方科研出示新一个多关键点的分享结构框架。种兼容合并资源采用既挖深了小编对药材配方基本成分在大分子范畴上对身体身理和病症心态的会影响，而是为揭露药材配方的目的缘由和疗效有害物质条件出示了强有效的的工具。
常见妇科疾病改善机能：两组学能力应该主要用于探析中药才改善常见妇科疾病的碳原子机能。举例说明，采用高蛋白质质组学和基础排泄组学的协同用，探求了与老中医等级分类的膝髋骨节骨性髋骨节炎频繁相关联的相互影响表达爱高蛋白质和基础排泄环路。
细胞代谢组学技術在中草药才研发中的拜谱生物，为中草药才的工业化化和精准性的医疗卫生保证了核心的科学有效搭载，能够推向中草药才的标准规范化和知名化的发展。