
近日,南京市医科读书一其他青岛博士整形医院医院王学浩院士评选团队图片在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向药物能源细胞代谢检测分析服务。
英文版名称:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
2英文网站标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
业主单位名称:南京医科大学
分析文件:细胞
拜谱提供数据的服务:转录组测序+淀粉酶互作组+靶点能量转换代谢转化组
技术应用自驾路线:
设计导致
01、YBX1被签定为HCC中糖酵解的关键所在人类基因
本的研究提取HCC肺部癌肿子样本(n=7)的单结构肿瘤细胞膜RNA测序统计资料集实施解析,看见糖酵解可溶性最主要聚集在肺部癌肿结构肿瘤细胞膜中,hdWGCNA解析认别出9个人类基因电源模块(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的求生解析判断YBX1为孤立求生的风险各种因素(图1H)。更进一步一个脚印根据IHC、WB进行实验和肺部癌肿结构与相邻非肺部癌肿结构的位置转录组学统计资料集可确认YBX1是肝结构肿瘤细胞膜癌冶疗的内在的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被判定为调HCC受损细胞糖酵解的至关重要条件
02、YBX1使得HCC中的有氧糖酵解和增值
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗能量转换分解代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1加速HCC中的有氧糖酵解和繁殖
03、OGT与YBX1搭配并促使YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合起来并推动YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化改善其磷过酸,以此催进其核转位
进三步测试YBX1的O-GlcNAc糖基化有无危害其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT遏药物OSMI-1治理 ,YBX1核淀粉酶能力方向面偏态调低,YBX1磷酸性反应偏态缩短(图4A-C)。IP实验操作信息显示,在一模一样的Flag-YBX1底物能力方向面下,YBX1-WT的磷酸性反应能力方向面偏态高过YBX1-T57A,阐明磷酸性反应的提高不只仅是根据越高的YBX1核淀粉酶展示(图4D)。分离法了核和质多组分会感觉TMG治理 的HCC神经元中YBX1核展示的增加(图4E-F),进三步会感觉YBX1磷酸性反应的要点设定指数是AKT(图4G-I)。这会感觉着重指出O-GlcNAc糖基化根据推动其磷酸性反应来提高YBX1核淀粉酶平稳性并推动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 遮盖有效于其进第一步发生的磷过酸遮盖并能有助于其核转位
05、YBX1推动PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1促使PKM2转录
06、YBX1 并能不断提高组蛋清乳碱化淡化的水平
论述出现YBX1敲低取得降核氨基酸乳碱化,需要是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解遏药制剂2-DG的实验所否认了糖酵解与组核蛋清乳碱化的同时关连,遏制糖酵解可取得降H3K18la程度(图6D)。PKM2过传达可逆反应转YBX1敲低造成的的H3K18la急剧下降,之外源乳酸正确处理不禁不断提升H3K18la,还随之YBX1传达上涨,提升普遍存在顺向返馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR否认,H3K18la根据含有于YBX1初始化子同时力促其转录,该历程受O-GlcNAc糖基化调整(图6H-J),并出现P300 上涨是YBX1增強H3K18乳酰化为用的制度(图6K-L)。
图6.YBX1加强H3K18乳硝化作用修饰语程度
软文总结ppt
在仅仅论述中通讯稿了YBX1在HCC中高理解,或者与糖酵破解切涉及到的。YBX1在T57处被O-GlcNAc体现,为了相对稳定膳食纤维质并添加其理解。这般体现还使得YBX1在T57处的磷酸性反应,使得其核易位。因,此具体步骤增強了糖酵解涉及到的什么是dna的转录并激刺乳酸的存在。另外,YBX1激发P300的转录,接着驱动器组膳食纤维的乳酸性反应,比较是H3K18la,H3K18乳酸性反应正在向调空YBX1什么是dna转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因正反面馈环体制图
拜谱个人总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物工程为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶点电量分解代谢组技术服务,拜谱生物技术建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、翻譯后突显组学、产生组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
关联性文献资料
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.