
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应呈现淀粉酶组学产品,实现1000+艰深度体现位点查出,稳定性初现著名靶点,全方向位置生信阐述解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发觉”到“手机验证”全注意事项业务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、调查具体步骤
02、实际数值
03、经“点”再现
在测试统计资料中,检测出多家论文参考文献中媒体报道的经典的靶点极其衣康酸淡化位点,如首个被得知的衣康酸共价淡化蛋清KEAP1,仍有糖酵解径路中的3个关键性点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,各类炎性小体分解成蛋清NLRP3和内部萎缩全过程中的关键性点蛋清RIPK3等,其质谱图有以下几点图随时。
04、食品亮点
1.强有力的加密管控质控
商家化炎症因子聊天探头孵育、SDS-PAGE判断、WB确认、范例关于性分折等多方面位判断,切实保障楼盘然而稳定性。2.高耐磨性质谱检测仪器手机平台
在Orbitrap Astral全新新一波的高辨别质谱仪六道金刚咒下,实现了衣康碱化体现位点及蛋白酶检验新程度,转向科学技术钻研新表明。3.全步奏一走式保障
依托于拜谱微生物完整的科学实验产品平台,可可以提供“人体细胞养育→探测器孵育→WB探测→深奥度衣康酸性反应突显探测→vip专享生信定性分析→某些位点PRM认证”全方案产品,省时杠杆原理更省时。05、剖析游戏内容(这部分)
06、应该用定位
PART 2、资料分析
学术论文一
用英文怎么说大标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
2英文名称:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
钻研游戏内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
学术论文二
英文字母主题词:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文翻译题头:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
设计玩法:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、成功案例并衍生一个构想
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具有着良好的底物通过工作能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱菌物衣康过酸突显组场地实测数据信息中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸掩盖(下列图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱个人总结
为TCA循环法中的中间的产生物,衣康酸改善产生、免役力和发炎两者的彼此之间实用功能,为冶疗免役力发炎性病毒出示了混用冶疗策略。衣康酸构造中的亲电性α,β-不过剩羧酸构造能对血清质上的渗透性半胱氨酸残基去烷基化呈现(迈克尔加上反馈),此种当地翻译后呈现被称作“衣康酸呈现(itaconation)”,而使影向血清质实用功能,房产调控免役力初次应答和产生路径,为不同病毒用量技术创新出示新要点。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸装饰核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物药学任何时候降钙素原检测靶向疗法分解组(QMT1000)或消耗的能量分解靶向疗法分解组物品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
参考价值文献综述
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.